Bevaring av ålegrasenger bør alltid være førsteprioritet i henhold til hierarkiet for avbøtende tiltak (se ovenfor), da restaurering er kostbart og vanskelig. Å restaurere ålegrasenger er krevende og har hatt lav suksessrate. En nøkkel for å lykkes er å ha en god forståelse av årsakene til at ålegras forsvinner, implementere avbøtende tiltak for å redusere de negative påvirkningsfaktorene, og å ha en helhetlig tilnærming i restaureringsprosessen som inkluderer både biotiske og abiotiske faktorer som påvirker overlevelse og veksten til ålegraset, inkludert tilhørende artsmangfold. Slik går man frem:
1) Identifiser hvorfor ålegrasenger har gått tapt, og om truslene er fjernet eller redusert. Optimalt sett må trusler som eutrofiering reduseres før restaurering. Hvis leveområdet har endret seg betraktelig (f.eks. sedimentet er destabilisert eller store mengder drivalger er til stede) kan det være vanskelig å gjenopprette ålegrasengen.
2) Velg områder med egnet leveområde for ålegras. Miljøforholdene bør stemme overens med levevilkårene til ålegras når det gjelder dybde, lys og vannkvalitet, strømhastighet, erosjonshastighet, bølgedemping, sedimentkvalitet og biologiske forstyrrelser fra for eksempel sandorm (Arenicola marina), strandkrabber (Carcinus maenas), sjøfugl, og drivalger.
3) Unngå å restaurere områder der ålegrasenger sannsynligvis vil komme tilbake av seg selv. En tommelfingerregel er å ikke restaurere områder nærmere enn 100 meter fra en frisk ålegraseng.
4) Fullskala restaurering bør kun utføres i områder hvor prøveplanting viser positiv vekst etter ett år og hvor andre variabler tilsier gode forhold for langsiktig gjenvekst av ålegras. Hvis plantene overlever på flere lokaliteter, bør lokalitetene med høyest veksthastighet velges for fullskala restaurering.
5) Nøye kystplanlegging og forvaltning er nødvendig for å beskytte eksisterende og restaurerte ålegrasenger.
- Skygge fra brygger/kaier har vist seg å utgjøre en trussel mot ålegrasenger langs nordvestkysten av Sverige. I samme område har studier også fastslått at ålegras sjelden blir tatt hensyn til når man skal bygge brygger. Verneområder er heller ikke nødvendigvis en garanti for vern av ålegrasenger fra utbygging av infrastruktur.
- Kystplanleggere bør også være bevisste på mulige negative effekter på ålegrasenger når de lager kunstige strender. Forskning har vist at kunstig sand fra nærliggende strender kan bli transportert til dypere vann og dermed mulig begrense omfanget av ålegrasengen ved å dekke til ålegrasplanter.
- Viktig å unngå karbon- og nitrogenutslipp fra tap av ålegras, da dette er negativt for klimaet og kan bidra til eutrofiering.
- En nylig gjennomgang av akvakulturanleggs påvirkning på ålegras viser at oppdrett av skalldyr kan ha både positive, nøytrale og negative effekter på ålegras. Positive interaksjoner inkluderer forbedret vannkvalitet og tilførsel av næringsstoffer, mens negative effekter som skyggelegging og sedimentering er vanligere i nærheten av skjelloppdrettsanlegg. Derimot finnes det begrenset forskning på fiskeoppdrettsanleggs effekter på ålegras, og det er rapportert om klare negative interaksjoner i studier av sjøgressarter i Middelhavet.
6) Spre risiko ved å restaurere flere områder over flere år. Det er stor naturlig variasjon i vekst og utbredelse av ålegrasenger mellom år, og tilfeldige hendelser som kraftige stormer, sjøis, ferskvannsutslipp, algeoppblomstring og høye sommertemperaturer kan gi lav overlevelse av utplantet ålegras. Restaurering kan være mer vellykket når planting skjer på flere steder over flere år.
7) Å restaurere store områder er bedre enn å restaurere små områder. Store ålegrasenger fungerer som "økosystemingeniører", og endrer havbunnens hydrodynamikk og biogeokjemi. Når en restaurert ålegraseng når en kritisk størrelse, etablerer den en selvforsterkende effekt, stabiliserer havbunnen, forbedrer vannkvaliteten og fremmer gunstige forhold for egen og andre arters vekst og overlevelse.
Forskning har undersøkt om småskala restaurering av ålegras kan gjøres enklere ved bruk av biologisk nedbrytbare etableringsstrukturer (BESEs) som stabiliserer sedimentene. Det har vist seg at bruk av BESE-strukturer økte overlevelsen av tidlig ålegras og suksessen til småskala restaurering av ålegras (og muslinger) i casestudier i Nord-Europa (Danmark, Finland, Norge og Estland). Småskala tiltak for å stabilisere sedimentene har derfor potensial til å øke suksessraten for ålegressrestaurering.